87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1008 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  308  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  94.84 
 
 		 155 aa  289  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  87.82 
 
 		 156 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  85.9 
 
 		 157 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  85.9 
 
 		 157 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  85.9 
 
 		 157 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  85.9 
 
 		 157 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  87.18 
 
 		 157 aa  274  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  87.74 
 
 		 155 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  86.54 
 
 		 157 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  86.54 
 
 		 157 aa  270  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  86.54 
 
 		 157 aa  270  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  86.54 
 
 		 157 aa  270  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  80.13 
 
 		 156 aa  260  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  80.77 
 
 		 157 aa  259  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  78.23 
 
 		 155 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  53.25 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  51.28 
 
 		 157 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  53.25 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  50.97 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  50 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  49.36 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  49.02 
 
 		 156 aa  153  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  47.4 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  48.37 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  47.4 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  47.4 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  47.4 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  47.4 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  47.4 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  45.1 
 
 		 156 aa  140  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  45.75 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  45.75 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  47.4 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  46.1 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  47.71 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  46.41 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  45.45 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  46.41 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  43.42 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  34.64 
 
 		 167 aa  94  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  32.21 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  35.06 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  33.12 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  28.19 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  40.57 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  40.57 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  27.52 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  30.19 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  36.52 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  30.97 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  30.15 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  30.15 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  27.92 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  30.97 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  32.67 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  28.26 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  35.61 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  35.23 
 
 		 478 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  24.5 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  25.56 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  25.56 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  31.11 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  30.47 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  28.68 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  27.07 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  26.8 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  27.69 
 
 		 440 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  26.74 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  25.48 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  26.17 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  34.44 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  26.32 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  24.84 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  28.91 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  27.27 
 
 		 418 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  32.97 
 
 		 637 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  28.8 
 
 		 461 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  19.84 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>