46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1562 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  313  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  98.77 
 
 		 163 aa  311  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  39.26 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  39.26 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  41.48 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  39.07 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  37.58 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  31.06 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  36.3 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  40.83 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  33.95 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  34.46 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  34.51 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  32.37 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  32.37 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  28.86 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  28.86 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  29.93 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  27.12 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  28.19 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22.45 
 
 		 410 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  24.17 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  24.84 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  27.04 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  27.15 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  25.17 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  26.88 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  26.88 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  26.88 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  26.88 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  22.67 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  27.1 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  27.1 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  22.58 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  26.49 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  23.57 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  28.69 
 
 		 497 aa  40.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>