56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  956    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  35.05 
 
 		 466 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  33.01 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  33.18 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  33.41 
 
 		 510 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  32.14 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  30.86 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  31.57 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  31.48 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  30.36 
 
 		 529 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  32.05 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  30.03 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  29.73 
 
 		 531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  29.03 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  29.73 
 
 		 531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  29.46 
 
 		 531 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  28.07 
 
 		 555 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  29.62 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  29.52 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  28.16 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  27.38 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  26.38 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  28.54 
 
 		 634 aa  96.7  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  25.3 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  24.19 
 
 		 250 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.08 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  19.11 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.27 
 
 		 256 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  19.11 
 
 		 256 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  34.26 
 
 		 163 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  20.65 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  19.41 
 
 		 250 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.4 
 
 		 426 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  21.6 
 
 		 268 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  21.43 
 
 		 406 aa  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  22.45 
 
 		 267 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  23.51 
 
 		 253 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  22.43 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  27.9 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  23.97 
 
 		 251 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  21.35 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  27.47 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  21.45 
 
 		 422 aa  47.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  20.38 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  30.3 
 
 		 171 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  28.97 
 
 		 158 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  25.4 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  26.59 
 
 		 620 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  25.4 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  21.54 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  21.54 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  21.54 
 
 		 253 aa  43.9  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  21.54 
 
 		 253 aa  43.9  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  28.33 
 
 		 247 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  23.48 
 
 		 254 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  21.35 
 
 		 406 aa  43.5  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>