80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3441 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  82.27 
 
 		 406 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  82.51 
 
 		 406 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  82.51 
 
 		 406 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  83 
 
 		 406 aa  700    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  80.54 
 
 		 406 aa  678    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  90.64 
 
 		 406 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  81.03 
 
 		 406 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  852    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  81.28 
 
 		 406 aa  688    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  82.51 
 
 		 406 aa  695    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  79.51 
 
 		 411 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  82.76 
 
 		 406 aa  698    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  80.79 
 
 		 406 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  83 
 
 		 406 aa  700    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  83 
 
 		 423 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  82.76 
 
 		 406 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  58.19 
 
 		 408 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  50.74 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  49.02 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  28.47 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  27.99 
 
 		 420 aa  176  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  26.03 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  25.49 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  27.02 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  28.03 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  22.43 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1537  membrane protein  26.39 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  27.01 
 
 		 696 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  26.47 
 
 		 620 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  25.13 
 
 		 792 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  24.33 
 
 		 847 aa  93.6  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  27.66 
 
 		 869 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  25 
 
 		 731 aa  86.7  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  23.62 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  24.15 
 
 		 250 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  23.75 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.44 
 
 		 1078 aa  70.5  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  25.32 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.66 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  22.55 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  25.32 
 
 		 634 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.13 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  24.79 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  24.1 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  23.79 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  26.1 
 
 		 257 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  24.23 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  25.13 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  27.27 
 
 		 531 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  21.64 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  22.7 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  23.36 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  22.97 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  24.63 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  19.66 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  22.22 
 
 		 540 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  23.51 
 
 		 529 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  21.01 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  18.99 
 
 		 251 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2957  putative integral membrane protein  20.97 
 
 		 159 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646912 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47846  predicted protein  25.38 
 
 		 770 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  26.15 
 
 		 511 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  23.53 
 
 		 529 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  21.79 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  25.62 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  23.66 
 
 		 250 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  20.6 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  23.23 
 
 		 555 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  22.61 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  22.62 
 
 		 251 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  23.32 
 
 		 251 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  25.71 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  24.25 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  22.62 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  21.47 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  22.79 
 
 		 473 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  25.16 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  23.71 
 
 		 247 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  22.46 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  25.14 
 
 		 573 aa  43.1  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>