80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0231 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  84.73 
 
 		 406 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  84.24 
 
 		 406 aa  685    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  83.99 
 
 		 406 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  85.71 
 
 		 406 aa  715    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  87.19 
 
 		 406 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  83.5 
 
 		 406 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  84.48 
 
 		 406 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  84.48 
 
 		 406 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  85.47 
 
 		 406 aa  688    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  84.98 
 
 		 406 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  86.95 
 
 		 406 aa  719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  83 
 
 		 422 aa  699    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  82.64 
 
 		 411 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  84.48 
 
 		 406 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  84.98 
 
 		 406 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  850    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  58.58 
 
 		 408 aa  481  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  51.23 
 
 		 408 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  48.41 
 
 		 411 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  28.44 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  28.21 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  28.09 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  26.96 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  29.61 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  27.68 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1537  membrane protein  28.11 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  26.82 
 
 		 696 aa  113  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  23.68 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  24.54 
 
 		 792 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  28.5 
 
 		 869 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  24.87 
 
 		 847 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  27.29 
 
 		 620 aa  93.6  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.88 
 
 		 731 aa  87.4  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.58 
 
 		 1078 aa  80.1  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  26.67 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  27.04 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  24.04 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  23.77 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  24.93 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  25.07 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  25.11 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  24.18 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  25.42 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  24.58 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  25.82 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  25.42 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  25.2 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  26.16 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.73 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  23.39 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  21.55 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  24.68 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  22.68 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  22.38 
 
 		 531 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  24.08 
 
 		 529 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  23.11 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  18.53 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  23.23 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47846  predicted protein  24.03 
 
 		 770 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  22.84 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  22.51 
 
 		 555 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  20.05 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  22.07 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  21.51 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2957  putative integral membrane protein  20.97 
 
 		 159 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  20.95 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  24.38 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  26.44 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  22.62 
 
 		 250 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  24.5 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  22.28 
 
 		 211 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  35.64 
 
 		 150 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  21.65 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  23.86 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  23.86 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  25.9 
 
 		 573 aa  43.5  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  21.65 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  21.03 
 
 		 258 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  32.14 
 
 		 148 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  23.86 
 
 		 531 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>