86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5838 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  71.51 
 
 
529 aa  682    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  82.73 
 
 
531 aa  761    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1031    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  82.92 
 
 
531 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  82.73 
 
 
531 aa  761    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  75.82 
 
 
555 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  41.1 
 
 
464 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  36.93 
 
 
474 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  37.04 
 
 
510 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  38.84 
 
 
466 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  37.18 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  33.72 
 
 
473 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  35.17 
 
 
465 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  31 
 
 
509 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  33.09 
 
 
461 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  30.64 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  31.22 
 
 
511 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  29.24 
 
 
634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  30.54 
 
 
448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  32.54 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  35.64 
 
 
478 aa  126  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  29.24 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  30.41 
 
 
497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  28.24 
 
 
257 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.53 
 
 
256 aa  67  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.11 
 
 
256 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  26.51 
 
 
247 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  22.82 
 
 
256 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  21.67 
 
 
251 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  23.16 
 
 
266 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  23.72 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  22.13 
 
 
253 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  23.28 
 
 
266 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  24.08 
 
 
250 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  26.32 
 
 
258 aa  58.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  22.41 
 
 
256 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  24.14 
 
 
253 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  21.03 
 
 
253 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  21.03 
 
 
253 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  21.03 
 
 
253 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  24.17 
 
 
163 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  22.41 
 
 
251 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  22.57 
 
 
289 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  20.63 
 
 
253 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  21.09 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  20.63 
 
 
253 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  21.03 
 
 
253 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  20.63 
 
 
253 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  20.63 
 
 
253 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  24.18 
 
 
406 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  19.77 
 
 
259 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  23.11 
 
 
253 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  26.7 
 
 
261 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  25.64 
 
 
253 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  25.64 
 
 
253 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.18 
 
 
406 aa  50.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  26.59 
 
 
260 aa  50.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  22.52 
 
 
423 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  21.97 
 
 
411 aa  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  24.51 
 
 
406 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  23.84 
 
 
406 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  20.54 
 
 
252 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  20.7 
 
 
253 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  24.18 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.53 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  24.18 
 
 
406 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.43 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  24.18 
 
 
406 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  22.83 
 
 
254 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  22.83 
 
 
254 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  22.73 
 
 
262 aa  48.5  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  23.23 
 
 
259 aa  48.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  22.59 
 
 
406 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  25.54 
 
 
426 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  23.88 
 
 
419 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  29.05 
 
 
411 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  23.6 
 
 
267 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  23.78 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  23.78 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  23.78 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  18.5 
 
 
250 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  25.69 
 
 
540 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  30.34 
 
 
620 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  24.8 
 
 
436 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  19.68 
 
 
253 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  23.14 
 
 
420 aa  43.5  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>