59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1290 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 
620 aa  1150    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  28.57 
 
 
425 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  35.22 
 
 
463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  31.96 
 
 
531 aa  174  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  35.68 
 
 
550 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  36.93 
 
 
411 aa  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  34.58 
 
 
436 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  40.28 
 
 
540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  28.72 
 
 
406 aa  111  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  27.3 
 
 
422 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  27.71 
 
 
406 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  27.71 
 
 
406 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  27.71 
 
 
406 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  27.02 
 
 
406 aa  98.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  27.32 
 
 
406 aa  98.2  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  27.46 
 
 
406 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  26.91 
 
 
406 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  26.72 
 
 
406 aa  92.8  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  26.77 
 
 
406 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  26.77 
 
 
406 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  26.77 
 
 
406 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  26.54 
 
 
411 aa  89.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  26.35 
 
 
423 aa  87.4  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  27.14 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  24.18 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  23.69 
 
 
408 aa  76.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  22.62 
 
 
696 aa  69.7  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  32.33 
 
 
466 aa  64.7  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  22.62 
 
 
869 aa  64.3  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.65 
 
 
731 aa  62  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  25.82 
 
 
419 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.63 
 
 
260 aa  60.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  22.45 
 
 
847 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  21.45 
 
 
408 aa  58.9  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  25.75 
 
 
420 aa  58.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.34 
 
 
253 aa  57.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  22.59 
 
 
260 aa  57  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  20.34 
 
 
256 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  24.7 
 
 
467 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  25.75 
 
 
420 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  22.43 
 
 
250 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  20.34 
 
 
256 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  29.44 
 
 
531 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  29.44 
 
 
531 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  29.44 
 
 
531 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.17 
 
 
2313 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  30.83 
 
 
529 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.4 
 
 
1078 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  22.4 
 
 
792 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  27.13 
 
 
497 aa  47.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  27.5 
 
 
419 aa  47.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  28.02 
 
 
529 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  26.13 
 
 
555 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40.71 
 
 
830 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  25.53 
 
 
414 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.54 
 
 
1888 aa  45.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.21 
 
 
256 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.67 
 
 
256 aa  43.9  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>