57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03184 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  827    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  72.55 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  73.33 
 
 
420 aa  578  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  73.33 
 
 
420 aa  579  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  27.49 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  27.49 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  27.05 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  26.57 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  27.25 
 
 
406 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  27.25 
 
 
406 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  26.81 
 
 
406 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  26.57 
 
 
406 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  26.57 
 
 
406 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  25.49 
 
 
422 aa  166  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  28.67 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  26.35 
 
 
406 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  28.54 
 
 
408 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  26.59 
 
 
406 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  26.96 
 
 
423 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  27.34 
 
 
408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  27.64 
 
 
411 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  27.63 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  26.65 
 
 
411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  25.32 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  24.27 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  25.92 
 
 
540 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  26.17 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  25.63 
 
 
731 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  25.61 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  25.61 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  25.61 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.88 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1537  membrane protein  24.18 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.69 
 
 
253 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  22.16 
 
 
792 aa  63.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  24.89 
 
 
251 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  22.69 
 
 
260 aa  60.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 
250 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  22.52 
 
 
847 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  26.38 
 
 
256 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  24.11 
 
 
254 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  22.43 
 
 
696 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  24.8 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  22.54 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.36 
 
 
256 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  26.07 
 
 
261 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  24.89 
 
 
253 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  24.45 
 
 
257 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  28.16 
 
 
463 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  25.07 
 
 
869 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  25.87 
 
 
531 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  22.39 
 
 
458 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  21.61 
 
 
253 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  20.87 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  24.36 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  21.61 
 
 
253 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  28.71 
 
 
620 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>