92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0234 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  81.1 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  81.1 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  41.43 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  41.18 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  40.64 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  40.64 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  35.25 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  31.33 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  34.02 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  36.55 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  29.92 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  34.87 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  31.3 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  34.82 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  30.87 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  31.45 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  31.09 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  29.91 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  29.77 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  27.46 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  27.31 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  22.95 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  27.24 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  25.48 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.97 
 
 		 422 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  22.22 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  25.47 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  25.47 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  25.47 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  25.47 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  26.77 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  23.83 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  25.68 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  24.11 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  25.94 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  21.54 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  23.37 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  25.35 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  26.55 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  21.4 
 
 		 406 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  22.49 
 
 		 420 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  21.43 
 
 		 408 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  27.31 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  21.67 
 
 		 406 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  25.23 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  26.18 
 
 		 478 aa  53.9  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  22.27 
 
 		 406 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  20.87 
 
 		 406 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  25.91 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  20.9 
 
 		 406 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  21.31 
 
 		 406 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  21.31 
 
 		 406 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  21.31 
 
 		 406 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  22.09 
 
 		 420 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  24.88 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  24.3 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  26.74 
 
 		 473 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  22.32 
 
 		 411 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  24.41 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  24.41 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  20.87 
 
 		 406 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  20.87 
 
 		 406 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  20.87 
 
 		 406 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  23.4 
 
 		 461 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  26.88 
 
 		 468 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  21.31 
 
 		 406 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  23.63 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  24.37 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  25.51 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  30.53 
 
 		 573 aa  48.5  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  25.29 
 
 		 455 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  21.65 
 
 		 423 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  23.19 
 
 		 467 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  24.9 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  24.07 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  24.51 
 
 		 419 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  23.65 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  22.04 
 
 		 531 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  21.92 
 
 		 451 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  22.62 
 
 		 510 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  21.63 
 
 		 531 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  21.74 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  21.63 
 
 		 531 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  24.22 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  22.36 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  22.28 
 
 		 555 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  22.05 
 
 		 303 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  22.05 
 
 		 314 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  20.88 
 
 		 529 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>