111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1527 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  935    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  65.29 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  63.3 
 
 		 451 aa  559  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  65.36 
 
 		 458 aa  556  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  44.85 
 
 		 637 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  47.59 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  36.56 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  35.02 
 
 		 422 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  33.03 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  35.52 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  34.13 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  28.73 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  22.32 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  22.57 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  22.57 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  24.19 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  22.41 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  24.19 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  22.09 
 
 		 406 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  24.43 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  22.12 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  21.38 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  23.46 
 
 		 266 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  23.79 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  23.79 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  23.79 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  26.25 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  23.79 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  23.11 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  23.34 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  25.54 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  24.62 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  22.71 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  22.76 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  22.48 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  23.48 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  23.76 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  24.47 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  21.65 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  27.92 
 
 		 266 aa  57  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  27.92 
 
 		 266 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  21.91 
 
 		 448 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  21.11 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  27.92 
 
 		 266 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  23.72 
 
 		 266 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  21.11 
 
 		 406 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  21.11 
 
 		 406 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  22.14 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  22.36 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  24.38 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  23.94 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  24.8 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  22.54 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  22.62 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  27.39 
 
 		 266 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  24.47 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  33 
 
 		 164 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  23.28 
 
 		 252 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  27.61 
 
 		 260 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  34.83 
 
 		 193 aa  53.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  31.54 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  22.61 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  23.8 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  24.26 
 
 		 259 aa  50.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  25.87 
 
 		 258 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  25.95 
 
 		 253 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  20.75 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  21.19 
 
 		 406 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  22.22 
 
 		 529 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  22.01 
 
 		 262 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  23.31 
 
 		 253 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  22.73 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  25.29 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  27.04 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  23.42 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  23.42 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  28.17 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  28.47 
 
 		 314 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  28.47 
 
 		 314 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  26.03 
 
 		 314 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  28.47 
 
 		 314 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  23.42 
 
 		 510 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  30.34 
 
 		 256 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  30.34 
 
 		 256 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  26.9 
 
 		 277 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  20.09 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  30.34 
 
 		 256 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  30.56 
 
 		 277 aa  47  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  27.78 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  24.61 
 
 		 269 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  30.34 
 
 		 256 aa  47  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  23.33 
 
 		 267 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  22.78 
 
 		 256 aa  46.6  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  19.62 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>