132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0175 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 
433 aa  851    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  60.85 
 
 
422 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  52.11 
 
 
440 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  55.9 
 
 
420 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  54.95 
 
 
422 aa  359  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  35.84 
 
 
415 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  35.52 
 
 
455 aa  229  7e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  35.04 
 
 
451 aa  226  7e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  40.19 
 
 
637 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  35.94 
 
 
458 aa  216  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  38.51 
 
 
573 aa  209  7e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  31.68 
 
 
418 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  28.16 
 
 
256 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  28.16 
 
 
256 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  28.16 
 
 
256 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  27.76 
 
 
277 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  27.76 
 
 
274 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  27.76 
 
 
277 aa  87.4  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  29.88 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  27.16 
 
 
258 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  27.76 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  29.1 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  27.09 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  28.34 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  26.56 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  26.05 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  26.05 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  26.47 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  27.53 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  26.47 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  26.47 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  25.98 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  28.63 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  26.72 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  27.53 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  26.94 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  26.94 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  28.63 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  26.83 
 
 
266 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  27.73 
 
 
253 aa  77  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  26.26 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  28 
 
 
461 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  28.22 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  26.14 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  28.22 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  27.69 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  26.32 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  28.51 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  26.64 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  27.8 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  27.59 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  25.19 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  26.78 
 
 
273 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  25.39 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  26.37 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  24.94 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  27.27 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  26.45 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  26.55 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22.17 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  24.25 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  26.14 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  23.93 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  23.93 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  25.37 
 
 
498 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  23.93 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  26.12 
 
 
253 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  23.17 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  27.62 
 
 
261 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  25.19 
 
 
281 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  26.28 
 
 
411 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  28.25 
 
 
467 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  26.18 
 
 
511 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  25.73 
 
 
253 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  27 
 
 
267 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  28.23 
 
 
253 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  28.35 
 
 
268 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  27.69 
 
 
267 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  23.38 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  23.35 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  25.11 
 
 
251 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  25.59 
 
 
510 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  26.14 
 
 
253 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  24.7 
 
 
258 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  24.94 
 
 
468 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  24.94 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  39.33 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  27.34 
 
 
269 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  26.85 
 
 
529 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  23.71 
 
 
792 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  29.73 
 
 
168 aa  50.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>