97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3640 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 467 aa  904    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  51.54 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  41.32 
 
 		 510 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  43.28 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  36.95 
 
 		 555 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  40.36 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  35.84 
 
 		 529 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  41.51 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  38.44 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  41.51 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  41.24 
 
 		 531 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  34.35 
 
 		 509 aa  189  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  36.52 
 
 		 473 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  37.06 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  32.48 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  38.13 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  29.17 
 
 		 498 aa  154  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  31.98 
 
 		 468 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  33.08 
 
 		 475 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  31.3 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  29.87 
 
 		 511 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  30.08 
 
 		 634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  30.39 
 
 		 497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  82.8  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  25.91 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  26.91 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  25.91 
 
 		 256 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  26.51 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  25.78 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  24.27 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  26.34 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  24.21 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  27.7 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  23.72 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  27.95 
 
 		 251 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  23.91 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  24.12 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  22.71 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.71 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  22.58 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.4 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  23.67 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  23.81 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  23.32 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  23.32 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  22.93 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  22.93 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  27.59 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  23.63 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  23.87 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  22.93 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  23.71 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  23.17 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  23.63 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.39 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  30.43 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  22.8 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  24.88 
 
 		 260 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  26.43 
 
 		 620 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  22.88 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  25.56 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  22.68 
 
 		 266 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  22.22 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  21.77 
 
 		 266 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  21.77 
 
 		 266 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  23.23 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  18.5 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  26.86 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  21.77 
 
 		 266 aa  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  26.98 
 
 		 143 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  22.81 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  22.81 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  17.72 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  22.08 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  23.19 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  23.55 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  27.83 
 
 		 150 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  23.47 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  21.62 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  29.25 
 
 		 164 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  17.79 
 
 		 252 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  26.8 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  33.8 
 
 		 140 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  26.23 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  27.61 
 
 		 163 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  26.13 
 
 		 150 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  20 
 
 		 262 aa  43.5  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  23.04 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  26.13 
 
 		 150 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  17.32 
 
 		 253 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  43.5  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  21.46 
 
 		 262 aa  43.1  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>