60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0810 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 474 aa  921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  51.42 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  40.81 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  39.86 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  39.86 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  38.38 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  39.58 
 
 		 555 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  40.37 
 
 		 531 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  40.37 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  40.37 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  37.11 
 
 		 466 aa  199  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  34.42 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  31.04 
 
 		 509 aa  170  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  35.49 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  30.39 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  32.05 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  30.8 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  33.83 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  29.44 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  30.4 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  28.5 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  29.55 
 
 		 634 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  30.22 
 
 		 448 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  25.3 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  25.3 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  22.22 
 
 		 256 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  21.4 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  23.29 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  24.22 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  20.45 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  21.91 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  26.03 
 
 		 259 aa  55.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  24.38 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22.3 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  21.91 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  22.13 
 
 		 258 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  22.4 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  27.54 
 
 		 152 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  24.51 
 
 		 254 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  21.74 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  24.51 
 
 		 254 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  23.95 
 
 		 251 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  22.48 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  21.74 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  26.14 
 
 		 164 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  26.14 
 
 		 164 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.62 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  21.25 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  23.51 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.63 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  33.67 
 
 		 157 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  33.94 
 
 		 159 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  20.81 
 
 		 260 aa  45.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  23.11 
 
 		 253 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  23.11 
 
 		 253 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  22.6 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  27.04 
 
 		 177 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  23.23 
 
 		 408 aa  43.9  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  27.5 
 
 		 150 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  22.11 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>