87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3914 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1026    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  82.73 
 
 		 529 aa  810    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  99.44 
 
 		 531 aa  1021    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1026    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  74.24 
 
 		 555 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  72.92 
 
 		 529 aa  688    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  43.35 
 
 		 464 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  37.7 
 
 		 510 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  38.9 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  41.51 
 
 		 466 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  39.08 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  34.88 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  33.05 
 
 		 509 aa  186  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  37.04 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  30.5 
 
 		 498 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  33.58 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  32.68 
 
 		 511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  30.68 
 
 		 634 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  32.93 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  31.53 
 
 		 448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  31.2 
 
 		 497 aa  136  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  36.92 
 
 		 478 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  29.62 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  29.96 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  25.19 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  22.14 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  23.55 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  23.22 
 
 		 266 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  21.92 
 
 		 289 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  28.86 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  21.58 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  24.89 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  22.47 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  22.59 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  23.57 
 
 		 262 aa  56.6  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  21.05 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  25.12 
 
 		 258 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.18 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  20.65 
 
 		 253 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  23.63 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  20.65 
 
 		 253 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  21.37 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  21.16 
 
 		 256 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  20.65 
 
 		 253 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  24.15 
 
 		 411 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  24.23 
 
 		 406 aa  53.9  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  20.65 
 
 		 253 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  20.65 
 
 		 253 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  20.65 
 
 		 253 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  23.91 
 
 		 406 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  24.6 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  24.91 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  20.62 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  20.65 
 
 		 253 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  21.05 
 
 		 253 aa  52  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  23.57 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  25.46 
 
 		 267 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  23.57 
 
 		 406 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  25.5 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  20.4 
 
 		 252 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  23.57 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  23.57 
 
 		 406 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  21.98 
 
 		 251 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  23.21 
 
 		 423 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  22.36 
 
 		 406 aa  50.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  22.71 
 
 		 254 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  21.65 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  21.49 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  22.71 
 
 		 254 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  24.07 
 
 		 268 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.29 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.23 
 
 		 406 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  26.55 
 
 		 260 aa  48.5  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  22.04 
 
 		 253 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  29.44 
 
 		 620 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  26.94 
 
 		 261 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  20.24 
 
 		 252 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  25.41 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  18.06 
 
 		 250 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.26 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  41.38 
 
 		 411 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  23.57 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  23.67 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  28.1 
 
 		 253 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  28.1 
 
 		 253 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  23.57 
 
 		 406 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  23.57 
 
 		 406 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>