142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2185 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  98.05 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  43.03 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  41.8 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  39.27 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  41.8 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  39.53 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  38.06 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  39.36 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  39.36 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  37.55 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  35.8 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  35.06 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  38.4 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  35.92 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  33.33 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  35.65 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  35.34 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  32.1 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  32.1 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  27.08 
 
 		 410 aa  95.9  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  31.09 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  29.67 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  26.91 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  25.11 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  23.83 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  27.43 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  27.71 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  27.71 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  27.71 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  25.11 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  24.48 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  25.73 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  27.31 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  24.03 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  25.3 
 
 		 474 aa  68.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.6 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.55 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  28.74 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  23.53 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  26.09 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  24.6 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  24.6 
 
 		 406 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  24.6 
 
 		 406 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.15 
 
 		 406 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  24.6 
 
 		 406 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  27.02 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  23.48 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  24.59 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  26.02 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  25.81 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  23.11 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  23.11 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  23.11 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  22.48 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  22.71 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  24.2 
 
 		 511 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  24.27 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  24.27 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  23.95 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  24.16 
 
 		 555 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  24.69 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  23.11 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  23.5 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  25.41 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  25.31 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  26.1 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  26.1 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  24.27 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  22.73 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  23.14 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  26.21 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  26.29 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  26.21 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  26.21 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  26.1 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  24.38 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  25.31 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  22.51 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  23.89 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  24.48 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  24.29 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  23.85 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  23.81 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  22.44 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  24.6 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  21.81 
 
 		 408 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  25.7 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  23.48 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  26.16 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  23.48 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  23.48 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>