73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00140 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  828    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  71.32 
 
 		 411 aa  608  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  51.72 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  50.74 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  50.49 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  50.49 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  50.49 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  50 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  49.51 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  50.25 
 
 		 406 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  50.25 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  50.74 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  51.23 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  50 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  49.02 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  50 
 
 		 411 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  49.51 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  49.26 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  49.26 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  30.05 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  29.57 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  27.49 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  28.54 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  25.62 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  25.19 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  24.12 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  25.41 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  26.2 
 
 		 731 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  23.69 
 
 		 620 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  26.32 
 
 		 869 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  23.64 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.76 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1537  membrane protein  22.85 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  23.14 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  22.69 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.21 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  23.17 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  23.54 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  24.56 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  23.99 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  22.95 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  24.18 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  26.92 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  23.67 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  21.1 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  23.1 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  21.61 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  21.81 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  21.91 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  23.25 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  23.25 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  20.4 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  21.79 
 
 		 254 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  21.79 
 
 		 254 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47846  predicted protein  26.6 
 
 		 770 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  20.76 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  20.47 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  20.85 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  27.03 
 
 		 531 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  25.42 
 
 		 267 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  21.97 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  24.32 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  22.76 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  30.48 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  21.99 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  24.79 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  23.76 
 
 		 1078 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  20.51 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  21.6 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  21.45 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  22.46 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  22.03 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>