32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1613 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  845    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  29.93 
 
 		 440 aa  86.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  25.43 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  24.35 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  23.2 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  20.59 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  27.56 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  27.27 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  22.85 
 
 		 637 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  23.46 
 
 		 433 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  27.35 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  21.92 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  24.54 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  24.51 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  28.93 
 
 		 167 aa  50.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  23.46 
 
 		 251 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  18.72 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.8 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  24.64 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  24.52 
 
 		 573 aa  47  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  25.76 
 
 		 171 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  21.97 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  25.19 
 
 		 262 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  20.95 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  25.32 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  22.02 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  20.97 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  22.54 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  21.83 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  24.06 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  24.68 
 
 		 253 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>