121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0019 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1183    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  71.92 
 
 		 637 aa  529  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  43.98 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  47.29 
 
 		 455 aa  283  8.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  47.24 
 
 		 451 aa  280  5e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  48 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  40.55 
 
 		 422 aa  210  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  37.58 
 
 		 422 aa  200  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  36.05 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  37.07 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  36.99 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  29.34 
 
 		 418 aa  110  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  31.08 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  31.08 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  31.08 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  35.37 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  35.37 
 
 		 279 aa  67  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  25.4 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  30.86 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  34.59 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  23.89 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  28.98 
 
 		 267 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  32.58 
 
 		 157 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  32.45 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  29.94 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  32.58 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  22.65 
 
 		 314 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  27.78 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  27.78 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22.26 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  57  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  22.33 
 
 		 314 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  32.09 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  22.33 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  28.89 
 
 		 268 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  27.78 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  33.04 
 
 		 253 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  22.01 
 
 		 314 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  27.54 
 
 		 258 aa  53.5  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  30.2 
 
 		 262 aa  53.5  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  27.22 
 
 		 274 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  30.46 
 
 		 303 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 		 461 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  29.1 
 
 		 253 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  24.29 
 
 		 164 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  29.1 
 
 		 253 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  28.36 
 
 		 253 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  26.32 
 
 		 792 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  28.36 
 
 		 253 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  25.28 
 
 		 421 aa  51.2  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  27.11 
 
 		 269 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  28.36 
 
 		 253 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  28.36 
 
 		 253 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  28.36 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  23.38 
 
 		 251 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  27.61 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  30.3 
 
 		 161 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  22.11 
 
 		 256 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  25.65 
 
 		 259 aa  48.9  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  30.53 
 
 		 254 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  22.68 
 
 		 406 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  24.65 
 
 		 696 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  27.78 
 
 		 193 aa  47.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  21.43 
 
 		 253 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  24.55 
 
 		 422 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  32.63 
 
 		 164 aa  47.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  32.63 
 
 		 164 aa  47.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  47  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  28.29 
 
 		 267 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  26.47 
 
 		 156 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  30.56 
 
 		 252 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.97 
 
 		 406 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  21.43 
 
 		 163 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  25.68 
 
 		 164 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  30.11 
 
 		 157 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  30.71 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  28.17 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  27.04 
 
 		 253 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  33.67 
 
 		 157 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  27.27 
 
 		 163 aa  45.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  23.29 
 
 		 174 aa  45.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  31.63 
 
 		 157 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  31.63 
 
 		 157 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  31.63 
 
 		 157 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  24.82 
 
 		 261 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>