117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1520 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 251 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  44.22 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  35.08 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  34.68 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  33.73 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  34 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  30.04 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  33.6 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  28.29 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  31.45 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  28.34 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  28.35 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  30.86 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  28.74 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  27.17 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  26.72 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  27.92 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  26.72 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  26.09 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  27.98 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  27.98 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  27.46 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  28.35 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  25.61 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  25.85 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  24.9 
 
 		 466 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  28.75 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  26.64 
 
 		 464 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  23.37 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  24.22 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  24.6 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  25.4 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  22.52 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  24.51 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  22.14 
 
 		 531 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  22.14 
 
 		 531 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  22.22 
 
 		 555 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  21.77 
 
 		 529 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  21.05 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  21.83 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  21.83 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  21.83 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  21.83 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  21.83 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  21.83 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  20.65 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  25.27 
 
 		 509 aa  58.9  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  24.12 
 
 		 634 aa  58.5  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  21.83 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  22.66 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  20.17 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  22.53 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  22.13 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  22.18 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  20.97 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  23.29 
 
 		 461 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  24.8 
 
 		 468 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  19.83 
 
 		 406 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  20.97 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  21.37 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  21.37 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  20.55 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  20.97 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  22.31 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  18.97 
 
 		 406 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  20.55 
 
 		 314 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  20.39 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  23.02 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  19.41 
 
 		 406 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  20.56 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  20.56 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  20.55 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  24.38 
 
 		 421 aa  52  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  20.55 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  20.55 
 
 		 314 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  21.2 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  20.56 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  22.66 
 
 		 406 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  20.95 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  20.92 
 
 		 408 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  20 
 
 		 422 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  22.13 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  19.12 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  21.77 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  19.85 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  19.47 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  21.76 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  23.53 
 
 		 473 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  20.87 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  20.87 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  22.22 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  21.34 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  24.23 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  25.42 
 
 		 448 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  21.05 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  21.48 
 
 		 406 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  22.58 
 
 		 475 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  22.92 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  20.73 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  19.28 
 
 		 540 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>