113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0301 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  44.22 
 
 		 251 aa  208  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  36.44 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  35.57 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  35.18 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  36.68 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  34.15 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  36.14 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  33.2 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  36.55 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  32.92 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  35.6 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  36.4 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  35.22 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  32.53 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  27.69 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  31.98 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  30.74 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  30.74 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  30.08 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  29.66 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  23.6 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  27.51 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  27 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  22.4 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.38 
 
 		 406 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  25.19 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  27.2 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  25.91 
 
 		 461 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  24.81 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  22.8 
 
 		 531 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  24.81 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  24.81 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  22.8 
 
 		 531 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  22.8 
 
 		 531 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  24.81 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  24.81 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  24.81 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22.89 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  23.67 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  21.46 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  24.41 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  24.42 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  24.42 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  23.6 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  21.83 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  22.22 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  22.22 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  22.22 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  25.48 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  23.08 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  22.22 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  22.8 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  22.4 
 
 		 555 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  23.08 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  23.2 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.73 
 
 		 422 aa  58.9  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  23.2 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  23.2 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  21.83 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  22.09 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  24.29 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  20.87 
 
 		 406 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  20.87 
 
 		 406 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  20.87 
 
 		 406 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  23.71 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  23.33 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  23.92 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  20.25 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  21.05 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  21.83 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  21.83 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  25.9 
 
 		 464 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  21.83 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  20.08 
 
 		 406 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  22.32 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  21.25 
 
 		 406 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  20 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  22.4 
 
 		 408 aa  52.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  21.51 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  25.51 
 
 		 540 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  23.02 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  24.49 
 
 		 448 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  24.42 
 
 		 473 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  21.96 
 
 		 475 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  20.72 
 
 		 423 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  20.83 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  21.69 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  21.25 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  21.03 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  22.22 
 
 		 634 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  21.69 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  21.69 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  21.69 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  22.98 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  22.58 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  23.29 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  22.76 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>