105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4901 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  98.41 
 
 
314 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  98.09 
 
 
314 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  98.73 
 
 
314 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  98.35 
 
 
303 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  88.64 
 
 
277 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  88.64 
 
 
277 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  88.26 
 
 
277 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  88.26 
 
 
274 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  89.53 
 
 
256 aa  484  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  89.53 
 
 
256 aa  484  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  89.53 
 
 
256 aa  484  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  87.88 
 
 
274 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  89.53 
 
 
256 aa  484  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  86.77 
 
 
258 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  72.44 
 
 
279 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  74 
 
 
266 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  74 
 
 
266 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  71.21 
 
 
260 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  72.44 
 
 
273 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  73.6 
 
 
266 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  73.6 
 
 
266 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  70.87 
 
 
258 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  52.4 
 
 
262 aa  277  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  53.17 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  51.55 
 
 
258 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  52.57 
 
 
266 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  48.85 
 
 
259 aa  265  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  47.92 
 
 
289 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  51.43 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  48.82 
 
 
252 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  47.79 
 
 
253 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  47.79 
 
 
253 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  48.19 
 
 
253 aa  242  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  47.77 
 
 
253 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  46.99 
 
 
253 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  47.37 
 
 
253 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  47.37 
 
 
253 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  47.97 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  48.19 
 
 
253 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  46.96 
 
 
253 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  46.18 
 
 
252 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  46.96 
 
 
253 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  43.72 
 
 
253 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  45.34 
 
 
253 aa  222  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  48.19 
 
 
253 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  43.63 
 
 
267 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  43.63 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  44.27 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  41.18 
 
 
239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  27.95 
 
 
258 aa  92.4  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  25.1 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  24.34 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  30.57 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  27.73 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  27.75 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  24.47 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.76 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  23.23 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  23.23 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  25.4 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  29.02 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  27.4 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  26.72 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  26.05 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  27.48 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  29.69 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  27.56 
 
 
468 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  22.49 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  26.46 
 
 
268 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  25.31 
 
 
247 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  22.08 
 
 
256 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  24.29 
 
 
256 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  21.67 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.89 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  24.48 
 
 
422 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  24.03 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  25.87 
 
 
451 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  22.78 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  29.8 
 
 
573 aa  53.5  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  25.45 
 
 
475 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  20.65 
 
 
250 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  26.69 
 
 
422 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  25.62 
 
 
511 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  23.88 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  22.58 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  22.58 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.81 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  20.75 
 
 
634 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  22.86 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  23.48 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  25.1 
 
 
458 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  26.03 
 
 
455 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  20.6 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  20.55 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  23.97 
 
 
473 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  23.83 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  23.83 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  26.35 
 
 
637 aa  47  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2957  putative integral membrane protein  29.29 
 
 
159 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>