108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1964 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  549  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  93.31 
 
 
267 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  82.09 
 
 
262 aa  441  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  42.42 
 
 
262 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  42.69 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  43.08 
 
 
258 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  43.63 
 
 
314 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  43.46 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  44.23 
 
 
274 aa  215  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  43.08 
 
 
314 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  43.85 
 
 
274 aa  214  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  43.08 
 
 
314 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  43.08 
 
 
314 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  43.85 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  43.85 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  43.85 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  40.45 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  43.85 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  43.85 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  43.85 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  40.45 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  40.75 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  43.46 
 
 
277 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  40 
 
 
259 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  42.15 
 
 
258 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  40.15 
 
 
266 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  40.91 
 
 
260 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  40.15 
 
 
289 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  41.15 
 
 
273 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  41 
 
 
279 aa  201  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  39.92 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  40.08 
 
 
253 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  37.74 
 
 
258 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  39.2 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  39.2 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  37.74 
 
 
252 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  39.2 
 
 
253 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  39.2 
 
 
253 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  39.2 
 
 
253 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  38.8 
 
 
253 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  37.7 
 
 
253 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  38.89 
 
 
253 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  38.49 
 
 
261 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  38.8 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  37.7 
 
 
253 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  40.24 
 
 
239 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  28.17 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  28.57 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  27.17 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  29.21 
 
 
281 aa  82  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  29.37 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  25.57 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  25.69 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  27.1 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  27.1 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  28.43 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  32.03 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.29 
 
 
426 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  24.9 
 
 
422 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  23.66 
 
 
420 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  25.27 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  34.71 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  24.03 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  24.89 
 
 
468 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  24.38 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  27.53 
 
 
433 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.97 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  22.88 
 
 
509 aa  58.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.94 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  20.95 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  24.32 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  21.71 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  25.19 
 
 
253 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  25.19 
 
 
253 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  23.48 
 
 
475 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  21.17 
 
 
634 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  28.89 
 
 
573 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  26.38 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  23.11 
 
 
455 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  23.79 
 
 
529 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  23.33 
 
 
451 aa  52.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  23.35 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  27.13 
 
 
260 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  22.62 
 
 
448 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  23.41 
 
 
415 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  24.16 
 
 
531 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  24.16 
 
 
531 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  26.32 
 
 
422 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  20.26 
 
 
418 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  23.79 
 
 
531 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  20.55 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  23.95 
 
 
511 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  21.84 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  24.05 
 
 
498 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  25.32 
 
 
257 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  28.12 
 
 
637 aa  46.6  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>