120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4593 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 422 aa  807    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  58.87 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  53.52 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  50 
 
 		 420 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  45.11 
 
 		 440 aa  305  9.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  36.43 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  36.19 
 
 		 451 aa  253  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  36.56 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  42.06 
 
 		 637 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  36.56 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  37.58 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  28.09 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  24.45 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  29.66 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  28.9 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  26.98 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  28.9 
 
 		 253 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  28.52 
 
 		 253 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  28.63 
 
 		 253 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  27.69 
 
 		 253 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  26.82 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  27.02 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  27.02 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  27.06 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  27.02 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  25.82 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  25.82 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  26.69 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  27.02 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  26.61 
 
 		 256 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  26.61 
 
 		 256 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  26.4 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  26.61 
 
 		 256 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  25.5 
 
 		 268 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  25.82 
 
 		 266 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  25.62 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  24.9 
 
 		 267 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  27.73 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  25.74 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  27.02 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  26.8 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  27.52 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  25.4 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  25 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  26.58 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  26.32 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  26.64 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  26.92 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  25.51 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  27.13 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  22.96 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  25.6 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  24.8 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  24.48 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  24.19 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  27.41 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  26.92 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  26.92 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  23.79 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  23.79 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  24.07 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  27.21 
 
 		 475 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  28.87 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  26.48 
 
 		 253 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  26.48 
 
 		 253 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  24.18 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  24.43 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  24.48 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  24.48 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  24.34 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  25.38 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  25.93 
 
 		 273 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  25.56 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  24.25 
 
 		 406 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  27.92 
 
 		 256 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.78 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  23.58 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  29.72 
 
 		 268 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  24.6 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  27.99 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  25.6 
 
 		 164 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  28.47 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  24.28 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  23.11 
 
 		 250 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  28.28 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  23.66 
 
 		 143 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  25.81 
 
 		 251 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  29.18 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  25.21 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  33.96 
 
 		 247 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  25.51 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  27.74 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.79 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  27.92 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  27.14 
 
 		 156 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.88 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>