135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1476 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 468 aa  913    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  69.91 
 
 		 475 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  45.31 
 
 		 448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  41.03 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  36.12 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  31.15 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  33.9 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  30.94 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  32.52 
 
 		 466 aa  144  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  34.19 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  29.69 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  28.64 
 
 		 474 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  28.34 
 
 		 529 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  30 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  31.92 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  31.92 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  31.92 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  28.16 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  31.49 
 
 		 465 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  28.3 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  27.8 
 
 		 555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  27.6 
 
 		 634 aa  97.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  27.82 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  26.05 
 
 		 256 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  25.23 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  22.8 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  23.68 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.98 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  28.23 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.47 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  23.15 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  22.41 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  27.23 
 
 		 258 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  27.56 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  27.56 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  25.79 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  27.11 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  27.11 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  27.11 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  25.4 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  25.4 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  25.4 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  29.57 
 
 		 164 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  22.22 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  29.57 
 
 		 164 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  25.4 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  25.12 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  24.89 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  22.65 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  26.58 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  23.38 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  25.75 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  25.41 
 
 		 260 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  24.19 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  23.01 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  26.59 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  24.67 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  26.34 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  26.34 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  25.19 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  26.27 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  24.38 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  24.19 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  24.19 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  22.98 
 
 		 256 aa  57  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  24.65 
 
 		 253 aa  57  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  24.12 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.98 
 
 		 256 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  24.49 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  23.61 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  25.4 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  20.63 
 
 		 150 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  20.63 
 
 		 150 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  23.72 
 
 		 252 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  27.16 
 
 		 150 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  23.43 
 
 		 266 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  25.12 
 
 		 253 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  26.09 
 
 		 164 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  24.19 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  24.19 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  24.19 
 
 		 253 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  21.89 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  24 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  26.77 
 
 		 157 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  27.55 
 
 		 152 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.61 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  26.15 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  25.2 
 
 		 247 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  23.49 
 
 		 158 aa  50.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  23.56 
 
 		 266 aa  50.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  23.56 
 
 		 266 aa  50.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  26.88 
 
 		 254 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  25.46 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  24.62 
 
 		 406 aa  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  23.45 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  24.71 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>