77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0555 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  313  8e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  35.88 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  32.31 
 
 
164 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  32.31 
 
 
164 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  32.09 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  33.95 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  32.37 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  34 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  33.58 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  34.15 
 
 
200 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  28.37 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  28.37 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  29.5 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  31.37 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  34.69 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  28.67 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  28.67 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  25.36 
 
 
461 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  27.54 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  23.49 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  28.78 
 
 
154 aa  58.2  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  26.06 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  27.56 
 
 
193 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  29.2 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  27.66 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  30.15 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  27.56 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  29.85 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  30.3 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  28 
 
 
478 aa  48.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  27.74 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  29.85 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  28.97 
 
 
497 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  28.29 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  28.29 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  28.29 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  28.29 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  27.45 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  27.45 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  27.45 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  27.45 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  28.99 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  28.12 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  25.66 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  25.77 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  44.3  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  25.77 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  27.82 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  27 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  26.35 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  26.28 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  27.71 
 
 
475 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  25.66 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  27.91 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  27.41 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  27.08 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  27.08 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  32.56 
 
 
474 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  27.07 
 
 
157 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  27.08 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  27.07 
 
 
448 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  31.34 
 
 
411 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  28.71 
 
 
420 aa  40.8  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  28.71 
 
 
420 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.09 
 
 
426 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>