79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3579 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  98.04 
 
 		 157 aa  290  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  85.26 
 
 		 156 aa  270  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  84.62 
 
 		 156 aa  268  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  80.77 
 
 		 156 aa  261  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  81.41 
 
 		 156 aa  258  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  85.26 
 
 		 156 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  76.62 
 
 		 157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  76.62 
 
 		 157 aa  240  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  76.62 
 
 		 157 aa  240  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  76.62 
 
 		 157 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  75.97 
 
 		 157 aa  238  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  75.97 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  75.97 
 
 		 157 aa  236  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  75.97 
 
 		 157 aa  236  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  75.97 
 
 		 157 aa  236  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  75.97 
 
 		 157 aa  236  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  75.97 
 
 		 157 aa  236  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  75.97 
 
 		 157 aa  235  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  74.68 
 
 		 157 aa  231  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  62.25 
 
 		 161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  60.26 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  61.59 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  58 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  52.98 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  74.07 
 
 		 108 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  74.07 
 
 		 108 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  50.67 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  49.67 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  49.67 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  49.67 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  49.02 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  49.34 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  48.03 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  48.03 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  47.06 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  48.03 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  48.03 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  48.03 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  45.75 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  46.71 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  46.71 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  44.74 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  49.01 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  46.21 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  42.18 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  38.36 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  34.93 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  34.48 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  32.67 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  32.67 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  31.82 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  33.07 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  29.73 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  28.97 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  32.47 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  30.7 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  29.55 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  33.85 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  32.06 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  27.18 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  26.14 
 
 		 478 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  27.34 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  27.34 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  31.18 
 
 		 637 aa  47.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  24.09 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  29.27 
 
 		 440 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  25.37 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  26.26 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  27.08 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  23.57 
 
 		 150 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  23.57 
 
 		 150 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  23.64 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  26.44 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  31.33 
 
 		 464 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>