62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2543 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  87.42 
 
 		 159 aa  244  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  75.78 
 
 		 161 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2819  hypothetical protein  77.99 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  47.47 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  34.42 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  34.42 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  34.42 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  34.42 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  34.42 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  34.69 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  34.46 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  34.69 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  34.69 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  34.69 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  33.77 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  33.76 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  33.74 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  32.91 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  34.16 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  34.16 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  34.16 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  34.16 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  33.54 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  33.54 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  33.76 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  33.54 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  32.7 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  35.06 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  31.68 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  32.43 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  32.28 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  32.65 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  32.47 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  32.89 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  29.87 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  32.87 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  31.76 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  34.42 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  28.85 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  32.35 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  25.81 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  30.36 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  30.36 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  32.35 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  24.83 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  25.81 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  29.55 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  29.55 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  33.64 
 
 		 426 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  26.28 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  23.08 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>