77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0372 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 464 aa  890    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  53.51 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  45.28 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  43.28 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  42.92 
 
 		 529 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  40.99 
 
 		 474 aa  269  7e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  43.12 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  43.12 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  42.89 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  41.06 
 
 		 555 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  41.1 
 
 		 529 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  41.38 
 
 		 473 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  43.91 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  35.82 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  35.6 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  36.12 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  36.7 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  36.97 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  36.27 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  33.74 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  32.77 
 
 		 498 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  31.02 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  32.98 
 
 		 634 aa  142  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  29.4 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  26.56 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  24.48 
 
 		 256 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  27.4 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  25.3 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.65 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.79 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  21.46 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  24.07 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  28.64 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  24.49 
 
 		 257 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  27.59 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  32.58 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  21.98 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  27.71 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  22.98 
 
 		 250 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  23.7 
 
 		 253 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  28.77 
 
 		 253 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  23.87 
 
 		 254 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  28.77 
 
 		 253 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  23.87 
 
 		 254 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  25.24 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.12 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  23.87 
 
 		 261 aa  53.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.98 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  28.78 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  24.9 
 
 		 267 aa  50.8  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  29.1 
 
 		 253 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  22.49 
 
 		 289 aa  50.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  19.92 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  28.3 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.48 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  23.46 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  22.73 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  27.33 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  24.29 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  27.94 
 
 		 163 aa  47.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  21.89 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  22.58 
 
 		 258 aa  46.6  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  25.86 
 
 		 143 aa  46.6  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  25.8 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  23.85 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  28.78 
 
 		 161 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  20.81 
 
 		 458 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  25.36 
 
 		 150 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  25.36 
 
 		 150 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  35.11 
 
 		 156 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  26.92 
 
 		 200 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  31.97 
 
 		 157 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  24.28 
 
 		 268 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  25.81 
 
 		 148 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  23.31 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>