124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0908 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  33.98 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  35.8 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  34.38 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  35.02 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  35.41 
 
 		 260 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  33.07 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  36.89 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  33.61 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  32.41 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  31.68 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  32 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  32.11 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  30.49 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  32.67 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  32.67 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  30.89 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  31.45 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  27.38 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  30.87 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  25.42 
 
 		 410 aa  82  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  28.24 
 
 		 529 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  29.3 
 
 		 555 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  27.78 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  25.71 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  26.91 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  25.7 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  29.96 
 
 		 531 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  29.96 
 
 		 531 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  29.96 
 
 		 531 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  26.77 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.9 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  26.42 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  28.23 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  25.2 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  25.2 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  25.2 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  26 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  24.61 
 
 		 510 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  23.27 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  25.2 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  26.25 
 
 		 461 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  26.1 
 
 		 422 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  24.08 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  24.08 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  26.29 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  24.08 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  24.59 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  28.64 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.08 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  26.05 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  26.14 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  25.19 
 
 		 509 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  25.21 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  25.2 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  23.92 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  23.79 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  24.8 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  25.98 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  23.89 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  23.83 
 
 		 497 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  23.17 
 
 		 467 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  23.75 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  25.42 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  20.4 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  25.42 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  25.42 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  23.81 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  23.08 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  23.74 
 
 		 634 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  25.99 
 
 		 478 aa  53.9  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  23.63 
 
 		 419 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  22.18 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  23.14 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  25.64 
 
 		 426 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  22.59 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  23.6 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  24.45 
 
 		 419 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  24.1 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  22.5 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  23.29 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  23.29 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  22.92 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  23.05 
 
 		 420 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  23.29 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  21.29 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  19.65 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  23.29 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  23.27 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  23.14 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  21.54 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  21.54 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  22.89 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  21.54 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  22.89 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  21.29 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  21.54 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  21.29 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>