121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3700 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  917    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  39.77 
 
 		 510 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  41.38 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  36.52 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  36.77 
 
 		 529 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  33.72 
 
 		 529 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  33.41 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  37.44 
 
 		 466 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  40.05 
 
 		 465 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  34.19 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  32.21 
 
 		 474 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  34.88 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  34.88 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  34.65 
 
 		 531 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  33.71 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  34.15 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  33.17 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  31.33 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  33.25 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  33.49 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  31.07 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  30.36 
 
 		 634 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  33.83 
 
 		 478 aa  130  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.73 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  27.14 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  26.64 
 
 		 258 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  23.92 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  24.02 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  27.6 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  27.64 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  24.58 
 
 		 262 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  23.14 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.9 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  24.68 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  27.46 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  24.39 
 
 		 266 aa  57  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  23.95 
 
 		 260 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  27.05 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  27.05 
 
 		 277 aa  57  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.08 
 
 		 256 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.5 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  27.46 
 
 		 256 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  27.46 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  26.64 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  26.64 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  27.46 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  26.03 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  26.64 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  26.74 
 
 		 254 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  23.15 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  22.41 
 
 		 267 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  26.56 
 
 		 253 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  26.56 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  23.36 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  27.42 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  27.42 
 
 		 253 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  26.36 
 
 		 254 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  26.36 
 
 		 254 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  31.34 
 
 		 171 aa  54.3  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  23.77 
 
 		 259 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  23.4 
 
 		 455 aa  53.5  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  22.95 
 
 		 268 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.83 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  24.38 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  27.48 
 
 		 164 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  23.55 
 
 		 247 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  24.11 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  23.53 
 
 		 251 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  24.94 
 
 		 458 aa  52  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  23.53 
 
 		 260 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  23.36 
 
 		 266 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  24.39 
 
 		 253 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  20.56 
 
 		 289 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  23.97 
 
 		 314 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  23.97 
 
 		 314 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  24.61 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  25.95 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  23.97 
 
 		 314 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  23.97 
 
 		 314 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  24.61 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  25.89 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  26.34 
 
 		 252 aa  50.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  25.73 
 
 		 253 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  26.83 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  24.61 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.22 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  20.54 
 
 		 250 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.61 
 
 		 406 aa  48.5  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  22.31 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  23.66 
 
 		 792 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  46.88 
 
 		 420 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  25.37 
 
 		 156 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  27.27 
 
 		 174 aa  47.4  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  23.11 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>