83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0772 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  975    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  82.89 
 
 		 511 aa  770    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  44.18 
 
 		 634 aa  318  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  36.08 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  30.41 
 
 		 529 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  29.27 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  30.37 
 
 		 466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  30.11 
 
 		 529 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  32.79 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  31.38 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  28.42 
 
 		 555 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  30.23 
 
 		 531 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  28.3 
 
 		 531 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  28.3 
 
 		 531 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  28.78 
 
 		 510 aa  143  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  28.05 
 
 		 474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  36.04 
 
 		 478 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  29.93 
 
 		 465 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  24.9 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  28.16 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  29.13 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  26.88 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  27.54 
 
 		 497 aa  101  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  24.7 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.25 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  23.71 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  25.21 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  24.58 
 
 		 256 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  22.95 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  22.35 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  22.95 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  22.14 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  24.63 
 
 		 414 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  21.65 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  23.5 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  19.71 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  22.6 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.45 
 
 		 260 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  25.82 
 
 		 433 aa  53.9  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  24.22 
 
 		 440 aa  53.5  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  24.76 
 
 		 637 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  26.11 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  23.48 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  25.91 
 
 		 262 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  24.05 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  22.27 
 
 		 256 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.27 
 
 		 256 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  23.94 
 
 		 258 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  22.67 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  21.75 
 
 		 411 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  23.48 
 
 		 261 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  24.48 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  20.28 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  22.66 
 
 		 260 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  20.28 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  20.28 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  20.51 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  21.86 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  21.86 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  23.36 
 
 		 266 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  23.36 
 
 		 266 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 		 258 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  19.36 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  22.31 
 
 		 253 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  23.36 
 
 		 266 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  21.95 
 
 		 253 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  22.96 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  22.67 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  20 
 
 		 847 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  22.28 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  19.89 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  20.25 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  22.35 
 
 		 259 aa  45.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  24.3 
 
 		 418 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  20 
 
 		 696 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  22.66 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  21.72 
 
 		 266 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  32 
 
 		 200 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  21.34 
 
 		 869 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  24.58 
 
 		 261 aa  43.9  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  23.69 
 
 		 253 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  21.07 
 
 		 253 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>