79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0277 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  82.51 
 
 		 406 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  82.27 
 
 		 406 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  85.47 
 
 		 423 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  80.3 
 
 		 411 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  82.51 
 
 		 406 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  82.02 
 
 		 406 aa  693    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  82.76 
 
 		 406 aa  694    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  81.53 
 
 		 406 aa  682    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  82.27 
 
 		 406 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  82.27 
 
 		 406 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  84.48 
 
 		 406 aa  706    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  814    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  82.51 
 
 		 406 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  83.74 
 
 		 406 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  81.03 
 
 		 422 aa  683    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  82.27 
 
 		 406 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  57.53 
 
 		 408 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  50 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  47.79 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  28.15 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  28.33 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  28.09 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  26.59 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  26.46 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  27.86 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1537  membrane protein  27.89 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  24.31 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  26.72 
 
 		 696 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  26.63 
 
 		 620 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  27.06 
 
 		 869 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  23.02 
 
 		 792 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  23.08 
 
 		 847 aa  90.5  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  23.88 
 
 		 731 aa  90.1  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  26.97 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  26.1 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  24.68 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  25.51 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.03 
 
 		 1078 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  24.69 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.4 
 
 		 256 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.83 
 
 		 256 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  25.63 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  21.64 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  26.5 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  24.18 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  25.73 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  22.59 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  24.02 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  23.31 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  23.73 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  23.98 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  24.36 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  22.02 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  22.85 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  19.83 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  24.32 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  23.57 
 
 		 555 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  22.41 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  22.62 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  23.77 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  22.66 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47846  predicted protein  23.84 
 
 		 770 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  25.56 
 
 		 531 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  25.56 
 
 		 531 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  21.52 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  25.56 
 
 		 531 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  25.96 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  26.56 
 
 		 511 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2957  putative integral membrane protein  20.61 
 
 		 159 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  23.78 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  22.62 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  22.97 
 
 		 211 aa  47.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  23.08 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  36.84 
 
 		 148 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  19.95 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  22.05 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  19.19 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  34.67 
 
 		 173 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  34.67 
 
 		 173 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>