71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0629 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  840    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  99.29 
 
 		 420 aa  835    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  73.33 
 
 		 419 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  68.57 
 
 		 419 aa  544  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  29.3 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  28.47 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  29.98 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  28.19 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  27.71 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  30.05 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  28.5 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  28.21 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  27.47 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  27.47 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  27.47 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  29.3 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  29.06 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  27.23 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  27.47 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  27.23 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  27.23 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  28.09 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  27.78 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  28.15 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  26.57 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  26.8 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  26.8 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  26.5 
 
 		 250 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  24.86 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  26.23 
 
 		 731 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  24.26 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1537  membrane protein  24.67 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  22.11 
 
 		 847 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  21.53 
 
 		 792 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  26.14 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  22.68 
 
 		 696 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  26.04 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  24.9 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  22.71 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  25.68 
 
 		 620 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  23.38 
 
 		 869 aa  60.1  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  23.58 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  21.01 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  23.25 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.8 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  21.6 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  29.15 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  22.78 
 
 		 257 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  22 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  23.25 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  25.28 
 
 		 531 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  24.41 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  24.41 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  25.67 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  24.77 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  24.37 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  24.19 
 
 		 529 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  22.69 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  24.15 
 
 		 466 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  23.21 
 
 		 555 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  25.83 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  22.48 
 
 		 634 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.35 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  22.58 
 
 		 531 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  23.72 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  22.58 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  22.58 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  21.72 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>