68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0580 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  99.29 
 
 
420 aa  835    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  840    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  73.33 
 
 
419 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  68.57 
 
 
419 aa  544  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  29.54 
 
 
406 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  28.43 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  27.95 
 
 
406 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  27.99 
 
 
422 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  29.74 
 
 
411 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  28.26 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  29.57 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  28.44 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  29.56 
 
 
406 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  27.71 
 
 
406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  27.71 
 
 
406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  27.71 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  27.47 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  27.71 
 
 
406 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  29.06 
 
 
408 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  27.47 
 
 
406 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  27.47 
 
 
406 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  28.33 
 
 
406 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  28.26 
 
 
411 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  28.15 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  26.57 
 
 
540 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  26.92 
 
 
250 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  25.14 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  24.51 
 
 
425 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  26.1 
 
 
731 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  26.4 
 
 
254 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  26.4 
 
 
254 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  25.49 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1537  membrane protein  24.67 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  24.89 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  22.11 
 
 
847 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  21.29 
 
 
792 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  22.68 
 
 
696 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  25.76 
 
 
253 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  24.9 
 
 
256 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  23.98 
 
 
250 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  23.38 
 
 
869 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  22.31 
 
 
254 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.8 
 
 
256 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  26.51 
 
 
620 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  21.01 
 
 
260 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  23.25 
 
 
260 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  23.21 
 
 
257 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  23.62 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  21.88 
 
 
256 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  22.27 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  28.63 
 
 
463 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  25.76 
 
 
531 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  23.9 
 
 
253 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  23.9 
 
 
253 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  25.67 
 
 
510 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  24.77 
 
 
261 aa  50.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  24.41 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  24.73 
 
 
529 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  23.66 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  26.25 
 
 
529 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  22.92 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.35 
 
 
426 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  23.99 
 
 
411 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  23.58 
 
 
634 aa  44.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  23.87 
 
 
550 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  24.6 
 
 
436 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  24.83 
 
 
156 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>