79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1008    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  53.51 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  41.32 
 
 		 467 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  39.73 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  41.06 
 
 		 474 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  36.36 
 
 		 529 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  36.78 
 
 		 531 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  36.78 
 
 		 531 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  37.04 
 
 		 529 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  36.57 
 
 		 531 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  38.54 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  36.81 
 
 		 555 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  33.54 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  37.25 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  33.41 
 
 		 461 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  34.96 
 
 		 475 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  33.55 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  33.25 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  34.05 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  29.68 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  28.37 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  34.66 
 
 		 478 aa  156  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  30.29 
 
 		 634 aa  124  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  24.19 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  25.4 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  24 
 
 		 256 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  28.75 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  26.15 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  28.13 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  21.34 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.77 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  25.67 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  22.18 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.93 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.23 
 
 		 406 aa  53.5  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.23 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  22.01 
 
 		 250 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  26.56 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  24.15 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.23 
 
 		 256 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  21.6 
 
 		 406 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  23.05 
 
 		 254 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  26.4 
 
 		 150 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  23.05 
 
 		 254 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  22.73 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  24.07 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  23.68 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  23.68 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.23 
 
 		 256 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  22.52 
 
 		 289 aa  50.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  27.43 
 
 		 433 aa  50.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  25.34 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  26.92 
 
 		 251 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  22.05 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  24.51 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  22.92 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  25.34 
 
 		 158 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  26.24 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  23.5 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  26.24 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  28.26 
 
 		 150 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  23.18 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  23.02 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  27.94 
 
 		 143 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  31.82 
 
 		 142 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  21.86 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  21.57 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  25.21 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  44.3  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  22.62 
 
 		 254 aa  43.9  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  22.27 
 
 		 268 aa  43.9  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>