67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0233 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  300  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  84.67 
 
 		 150 aa  264  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  84.67 
 
 		 150 aa  264  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  53.42 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  53.38 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  53.38 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  43.08 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  36.88 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  38.58 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  35.33 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  35.43 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  31.06 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  36.11 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  36.11 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  31.91 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  31.91 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  35.11 
 
 		 200 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  29.91 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  28.48 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  27.54 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  30.49 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  27.69 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  26.92 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  29.67 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  26.92 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  25.56 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  26.92 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  26.92 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  26.92 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  27.07 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  26.15 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  27.45 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  26.15 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  26.15 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  26.15 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  26.15 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  24.81 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  26.17 
 
 		 475 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  26.92 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  30.08 
 
 		 440 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  26.15 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  23.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  26.52 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  27.07 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  32 
 
 		 478 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  27.07 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  28.97 
 
 		 467 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  25.36 
 
 		 464 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  27.07 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  27.07 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  27.07 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  27.07 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  30 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  25.76 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  22.73 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  25.37 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  27.16 
 
 		 468 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  25.58 
 
 		 458 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  23.74 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  22.63 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  22.63 
 
 		 150 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>