66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1521 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  300  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  44.44 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  32.87 
 
 
164 aa  95.9  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  33.78 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  33.78 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  39.72 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  30.2 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  37.58 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  37.58 
 
 
163 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  34.59 
 
 
173 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  34.59 
 
 
173 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  35.88 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  35.88 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  33.85 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  35.61 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  33.58 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  33.8 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  31.34 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  33.05 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  35.71 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  28.99 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  32.06 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  30.61 
 
 
410 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  31.9 
 
 
475 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  26.62 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  22.41 
 
 
440 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  27.27 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  26.23 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  27.83 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  24.14 
 
 
461 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  23.02 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  35.64 
 
 
423 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  25.89 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  25.36 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  22.22 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  27.35 
 
 
474 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  25.36 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  46 
 
 
406 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  46 
 
 
406 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  26.76 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  27.05 
 
 
464 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  34.48 
 
 
406 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  46 
 
 
406 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  46 
 
 
406 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  21.74 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  46 
 
 
406 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  44 
 
 
406 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  44 
 
 
406 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  44 
 
 
406 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  32.69 
 
 
406 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  25.36 
 
 
157 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  25.36 
 
 
157 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  25.36 
 
 
157 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  44 
 
 
406 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  23.91 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  23.91 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  23.91 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  23.91 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  32.98 
 
 
411 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  33.33 
 
 
422 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  19.84 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  22.43 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  23.91 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>