109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0887 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  82.89 
 
 
498 aa  773    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 
511 aa  999    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  44.12 
 
 
634 aa  318  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  32.93 
 
 
461 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  31.56 
 
 
529 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  30.52 
 
 
529 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  30.72 
 
 
466 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  33.17 
 
 
473 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  32.36 
 
 
531 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  32.36 
 
 
531 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  32.36 
 
 
531 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  31.49 
 
 
474 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  29.77 
 
 
510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  28.78 
 
 
555 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  31.01 
 
 
464 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  29.96 
 
 
467 aa  140  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  35.9 
 
 
478 aa  126  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  29.7 
 
 
468 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  29.44 
 
 
475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  30.54 
 
 
465 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  23.62 
 
 
509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  29.9 
 
 
497 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  28.67 
 
 
448 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  27.69 
 
 
253 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  26.61 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  26.94 
 
 
253 aa  67  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  27.35 
 
 
253 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  27.35 
 
 
253 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  27.35 
 
 
253 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  27.53 
 
 
253 aa  64.3  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  26.53 
 
 
253 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  26.53 
 
 
253 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  25.51 
 
 
253 aa  64.3  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  22.68 
 
 
406 aa  63.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  25.82 
 
 
253 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.36 
 
 
260 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  24.2 
 
 
256 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  24.2 
 
 
256 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  26.53 
 
 
253 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  26.53 
 
 
253 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  22.96 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.76 
 
 
406 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  62  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  26.61 
 
 
261 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  20.33 
 
 
406 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  20.33 
 
 
406 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  23.81 
 
 
252 aa  60.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  20.33 
 
 
406 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  22.93 
 
 
406 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  25.51 
 
 
253 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.07 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  24.02 
 
 
455 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  20.16 
 
 
406 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  20.11 
 
 
406 aa  57  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  21.55 
 
 
406 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  25.1 
 
 
258 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  21.55 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  21.55 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  21.93 
 
 
411 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  28 
 
 
637 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.46 
 
 
256 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  23.46 
 
 
256 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  19.95 
 
 
423 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  26.86 
 
 
262 aa  53.9  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  18.72 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  24.64 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  22.87 
 
 
289 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  25.93 
 
 
277 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  25.93 
 
 
256 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  25.93 
 
 
274 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  25.93 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  25.62 
 
 
314 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  25.93 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  31.08 
 
 
314 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  20.26 
 
 
847 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  25.93 
 
 
256 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  25.93 
 
 
256 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  25.93 
 
 
277 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  25.93 
 
 
277 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  25.21 
 
 
303 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  24.02 
 
 
259 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  25.93 
 
 
274 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  25.93 
 
 
256 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  22.49 
 
 
696 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  23.81 
 
 
266 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  22.46 
 
 
266 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  23.83 
 
 
258 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  22.83 
 
 
260 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  24.81 
 
 
260 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  21.83 
 
 
410 aa  49.3  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  25.83 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  24.63 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  24.71 
 
 
266 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  24.71 
 
 
266 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  24.71 
 
 
266 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  23.95 
 
 
268 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  24.42 
 
 
279 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  24.82 
 
 
411 aa  47  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  22.37 
 
 
262 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  22.25 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>