85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0954 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  69.79 
 
 
529 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  100 
 
 
555 aa  1085    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  76.85 
 
 
531 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  75.82 
 
 
529 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  76.85 
 
 
531 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  76.85 
 
 
531 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  41.06 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  38.66 
 
 
474 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  36.81 
 
 
510 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  37.83 
 
 
467 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  39.1 
 
 
466 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  38.18 
 
 
465 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  32.41 
 
 
509 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  31.75 
 
 
461 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  28.22 
 
 
498 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  29.96 
 
 
511 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  29.72 
 
 
634 aa  143  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  29.37 
 
 
448 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  30.84 
 
 
475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  33.93 
 
 
478 aa  120  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  27.85 
 
 
497 aa  118  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  30.77 
 
 
468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  30.15 
 
 
257 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  22.92 
 
 
256 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.33 
 
 
256 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.92 
 
 
256 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  22.73 
 
 
251 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  22.08 
 
 
256 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  23.05 
 
 
260 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  23.18 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  26.03 
 
 
250 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  27.54 
 
 
247 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  23.31 
 
 
253 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  22 
 
 
406 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  20.6 
 
 
406 aa  54.7  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  22.84 
 
 
411 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  22.98 
 
 
253 aa  53.5  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.93 
 
 
422 aa  53.5  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  21.67 
 
 
406 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  21.67 
 
 
406 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  21.67 
 
 
406 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  23.16 
 
 
266 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  21.98 
 
 
251 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  21.33 
 
 
406 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  21.33 
 
 
406 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  21.88 
 
 
252 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  21.83 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  24.02 
 
 
261 aa  51.6  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  22.57 
 
 
289 aa  51.2  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  26.86 
 
 
261 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  20.6 
 
 
423 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  22.19 
 
 
406 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  26.15 
 
 
620 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  23.43 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  22.45 
 
 
253 aa  48.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  18.26 
 
 
250 aa  47.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  22.66 
 
 
267 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  27.2 
 
 
426 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  21 
 
 
406 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  24.44 
 
 
420 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  20.2 
 
 
410 aa  46.6  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  21.84 
 
 
254 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  37.93 
 
 
411 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  21 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  21 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  21.84 
 
 
254 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  20.63 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  20.63 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  20.63 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  21.48 
 
 
252 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  25.53 
 
 
418 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  22.27 
 
 
268 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  24.07 
 
 
420 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  25.83 
 
 
1078 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  20.63 
 
 
253 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  21.54 
 
 
254 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  21.37 
 
 
259 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  21.93 
 
 
253 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  21.93 
 
 
253 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  20.51 
 
 
408 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  20.91 
 
 
415 aa  44.3  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  21.2 
 
 
253 aa  43.9  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  25.66 
 
 
267 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  19.84 
 
 
253 aa  43.9  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>