47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0674 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 436 aa  830    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  43.14 
 
 		 463 aa  289  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  35.6 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  41.76 
 
 		 550 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  32.13 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  34.79 
 
 		 620 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  27.54 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  29.44 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  26.72 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  26.72 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  26.72 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  25.13 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  24.94 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.56 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  25.25 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  26.23 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  28.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  24 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.69 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  22.43 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  23.1 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  24.69 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.63 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  25.27 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  23.77 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  23.77 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  23.77 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  25.87 
 
 		 467 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  24.57 
 
 		 792 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  23.1 
 
 		 847 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  23.81 
 
 		 869 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  24.19 
 
 		 256 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  22.76 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.72 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  25.51 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  25.41 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  25.41 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  25.79 
 
 		 261 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  25 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  24.08 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  25.24 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  24.52 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  20.94 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  22.89 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  21.98 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  19.83 
 
 		 256 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>