47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2684 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  842    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  28.57 
 
 
620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  31.16 
 
 
550 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  25.9 
 
 
463 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  26.56 
 
 
531 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  27.81 
 
 
411 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  27.5 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.43 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  26.55 
 
 
540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.43 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.4 
 
 
406 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.54 
 
 
406 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  24.03 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  24.03 
 
 
406 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  24.03 
 
 
406 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  23.92 
 
 
411 aa  106  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.75 
 
 
406 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  24.07 
 
 
406 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  24.07 
 
 
406 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  24.07 
 
 
406 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  24.07 
 
 
406 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  23.11 
 
 
406 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  22.98 
 
 
406 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  22.98 
 
 
423 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  24.12 
 
 
408 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  24.38 
 
 
408 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  24.27 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  23.59 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  25.7 
 
 
731 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  24.73 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  23.95 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  23.7 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  22.89 
 
 
260 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  22.69 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  23.36 
 
 
256 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  21.91 
 
 
259 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  21.05 
 
 
258 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.36 
 
 
256 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  21.05 
 
 
258 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  22.2 
 
 
696 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  20.91 
 
 
260 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  22.46 
 
 
869 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  21.37 
 
 
250 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  21.01 
 
 
387 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  23.85 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  20.93 
 
 
792 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  23.85 
 
 
421 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>