46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3833 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1065    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  43 
 
 
436 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  38.75 
 
 
463 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  34.5 
 
 
531 aa  227  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  37.1 
 
 
540 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  31.16 
 
 
425 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  35.78 
 
 
620 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  32.43 
 
 
411 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  26.26 
 
 
406 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  26.26 
 
 
406 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  26.26 
 
 
406 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  25.98 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  25.63 
 
 
406 aa  87  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  25.16 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  23.5 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  24.82 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.51 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  24.1 
 
 
422 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.93 
 
 
406 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  25.63 
 
 
406 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  25.27 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  24.79 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  24.79 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  24.51 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  24.12 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.73 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  25.07 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  24.18 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  25.44 
 
 
869 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  25.94 
 
 
792 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0454304 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  24.07 
 
 
847 aa  63.9  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  24.76 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  25.4 
 
 
256 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  24.79 
 
 
260 aa  60.5  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.89 
 
 
256 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  25.61 
 
 
419 aa  57.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  24.32 
 
 
420 aa  54.7  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  22.98 
 
 
1078 aa  53.9  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  24.31 
 
 
256 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.46 
 
 
256 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  23.77 
 
 
420 aa  50.8  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  27.42 
 
 
253 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  23.51 
 
 
250 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  23.77 
 
 
731 aa  47.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  22.46 
 
 
696 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  20.74 
 
 
260 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>