104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1962 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 352 aa  680    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  55.33 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  55.33 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  55.33 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  54.89 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  53.31 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  52.65 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  51.58 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  45.19 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  48.13 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  40.78 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  39.66 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  44.71 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  42.73 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  46.63 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  47.14 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  46.49 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  44.94 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  42.43 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  44.52 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  41.16 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  46.04 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  44.79 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  47.95 
 
 		 329 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  43.32 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  47.44 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  37.39 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  45.45 
 
 		 334 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  47.77 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  37.39 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  44.29 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  39.25 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  42.49 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  41.67 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  32.68 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.74 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  41.83 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  42.56 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  41.54 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  42.24 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  42.37 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  40.29 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  39.29 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  43.07 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  40 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  39.58 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  41.14 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  40.66 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  38.28 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  40.77 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  43.84 
 
 		 306 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  41.67 
 
 		 332 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  42.14 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  39.82 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  38.98 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  40 
 
 		 361 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  38.39 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  40.88 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  39.45 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  43.05 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  39.58 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  37.83 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  39 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  40.21 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  38.28 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  37.22 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  41.14 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  38.74 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  29.41 
 
 		 282 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  32.16 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  30.95 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  46.55 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  34.42 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  31.83 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  32.84 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  30.32 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  33.33 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  29.83 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  28.12 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  30.88 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  29.85 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  31.1 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  28.7 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  30.97 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  33.99 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  31.42 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  32.12 
 
 		 352 aa  49.7  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  43.75 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  31.19 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  31.93 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  25.49 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  28.08 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  30.37 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  29.1 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  30.37 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  27.81 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  32.14 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  31.72 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  25.18 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>