105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4112 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 358 aa  718    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  95.71 
 
 		 360 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  84.88 
 
 		 351 aa  579  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  82.85 
 
 		 352 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  54.09 
 
 		 358 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  54.73 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  54.1 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  53.15 
 
 		 352 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  55.9 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  50.46 
 
 		 341 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  52.49 
 
 		 364 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  53.17 
 
 		 352 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  54.14 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  54.14 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  54.14 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  54.44 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  52.99 
 
 		 354 aa  305  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  53.47 
 
 		 354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  53.87 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  51.44 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  49.85 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  53.78 
 
 		 357 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  51.67 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  51.3 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  53.41 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  48.64 
 
 		 358 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  49.7 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  49.7 
 
 		 340 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  41.14 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  46.26 
 
 		 345 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  40.8 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  42.31 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  40.62 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  37.93 
 
 		 373 aa  222  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  41.18 
 
 		 489 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  41.18 
 
 		 489 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  41.18 
 
 		 489 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  43.48 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  55.88 
 
 		 446 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  54.9 
 
 		 442 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  54.9 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  54.9 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  54.9 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  54.9 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  54.9 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  39.94 
 
 		 372 aa  212  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  40.75 
 
 		 371 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  45.12 
 
 		 348 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  39.35 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  38.53 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  41.07 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  39 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  40.58 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  37.08 
 
 		 352 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  38.67 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  39.42 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  37.9 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  40.91 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  38.04 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  37.33 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  39.23 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  39.23 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  39.23 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  36.8 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  37.28 
 
 		 377 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  39.01 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  40.22 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  38.46 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  38.46 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  38.46 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  39.08 
 
 		 369 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  41.58 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  41.58 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  38.46 
 
 		 376 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  38.46 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  38.46 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  37.54 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  40.07 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  40.07 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  40.07 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  40.43 
 
 		 369 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  40.43 
 
 		 369 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  40.85 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  39.93 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  40.43 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  36.39 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  29.92 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  29.75 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  29.37 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  27.83 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  30.03 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  26.51 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  27.94 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  28.01 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  26.71 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  30.37 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  32.08 
 
 		 184 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  29.52 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  27.06 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  25.9 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>