106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6180 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  100 
 
 
375 aa  753    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  68.53 
 
 
376 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  68.53 
 
 
376 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  68.53 
 
 
376 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  69.33 
 
 
376 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  69.33 
 
 
376 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  69.07 
 
 
376 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  68.6 
 
 
407 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  71.15 
 
 
369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  70.33 
 
 
369 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  67.76 
 
 
366 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  67.76 
 
 
366 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  70.33 
 
 
369 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  70.05 
 
 
369 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  69.67 
 
 
369 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  70.05 
 
 
369 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  69.13 
 
 
369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  67.76 
 
 
368 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  65.11 
 
 
369 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  62.53 
 
 
377 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  62.26 
 
 
372 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  52.99 
 
 
367 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  52.99 
 
 
367 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  52.99 
 
 
367 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  49.17 
 
 
371 aa  299  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  45.41 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  46.17 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  44.93 
 
 
489 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  44.93 
 
 
489 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  44.93 
 
 
489 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  43.4 
 
 
393 aa  245  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  43.55 
 
 
394 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  43.59 
 
 
463 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  44.2 
 
 
370 aa  242  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  44.69 
 
 
373 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  41.16 
 
 
372 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  42.35 
 
 
375 aa  232  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  39.12 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  41.92 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  41.71 
 
 
365 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  37.64 
 
 
373 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  43.03 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  42.65 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  41.46 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  42.9 
 
 
350 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  43.66 
 
 
381 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  42.65 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  43.39 
 
 
367 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  39.53 
 
 
345 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  41.64 
 
 
354 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  40.82 
 
 
347 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  41.11 
 
 
360 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  40.8 
 
 
364 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  40.39 
 
 
364 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  34.68 
 
 
369 aa  186  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  42.47 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  41.49 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  41.49 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  41.32 
 
 
360 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  41.5 
 
 
351 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  39.94 
 
 
352 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  39.32 
 
 
358 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  41.19 
 
 
360 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  39.23 
 
 
349 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  41.9 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  41.49 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  40.22 
 
 
358 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  39.71 
 
 
345 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  40.72 
 
 
360 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  40.29 
 
 
366 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  41.11 
 
 
357 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  34.34 
 
 
352 aa  175  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  40.98 
 
 
341 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  40.54 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  40.41 
 
 
340 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  43.11 
 
 
341 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  40.12 
 
 
340 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  40.41 
 
 
357 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  35.86 
 
 
446 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  38.26 
 
 
318 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  42.25 
 
 
442 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  42.25 
 
 
451 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  42.25 
 
 
448 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  42.25 
 
 
448 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  42.25 
 
 
442 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  42.25 
 
 
448 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  38.51 
 
 
184 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  28.29 
 
 
331 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  28.62 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  32.26 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  28.62 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  28.62 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  30.22 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  32.02 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  31.56 
 
 
340 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  28.66 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  32.32 
 
 
340 aa  49.7  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  28.21 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  30.71 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  28.38 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>