89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6011 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 373 aa  744    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  51.19 
 
 		 375 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  50.41 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  53.01 
 
 		 370 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  50.27 
 
 		 393 aa  322  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  50.26 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  47.54 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  48.79 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  48.79 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  48.79 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  45.74 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  47.18 
 
 		 489 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  46.93 
 
 		 489 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  46.93 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  47.06 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  47.06 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  47.06 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  46.13 
 
 		 463 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  44.54 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  45.95 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  46.65 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  47.15 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  42.44 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  46.79 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  46.79 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  47.06 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  46.19 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  47.43 
 
 		 369 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  45.04 
 
 		 369 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  47.43 
 
 		 369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  45.72 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  43.51 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  46.61 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  44.69 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  46.34 
 
 		 369 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  46.34 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  46.34 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  39.95 
 
 		 375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  42.51 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  39.46 
 
 		 376 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  43.17 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  40.88 
 
 		 352 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  42.32 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  41.36 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  42.38 
 
 		 360 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  34.83 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  38.51 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  39.55 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  41.64 
 
 		 358 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  37.19 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  40.11 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  41.19 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  41.19 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  44.51 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  41.52 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  40.18 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  40.72 
 
 		 348 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  40.9 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  41.16 
 
 		 360 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  40.64 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  41.46 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  40.71 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  40.11 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  40.85 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  41.72 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  40.41 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  38.1 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  38.18 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  38.97 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  39.94 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  38.34 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  38.76 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  38.58 
 
 		 341 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  38.62 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  38.57 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  38.31 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  38.31 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  38.95 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  36.16 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  38.68 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  37.74 
 
 		 448 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  37.74 
 
 		 448 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  37.74 
 
 		 448 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  37.74 
 
 		 442 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  37.74 
 
 		 451 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  37.74 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08608  D-aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03710)  37.22 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.344807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  28.71 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  29.36 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>