110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1383 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1383  D-aminopeptidase protein  100 
 
 		 341 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1256  peptidase S58 DmpA  82.99 
 
 		 341 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1322  peptidase S58 DmpA  82.99 
 
 		 341 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0281785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  70.96 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  67.64 
 
 		 364 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0136  aminopeptidase DmpA  67.54 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  70.66 
 
 		 352 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  68.42 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  67.37 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1661  aminopeptidase DmpA  68.34 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3240  peptidase S58 DmpA  66.57 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  63.99 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0839  aminopeptidase DmpA  63.85 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4055  peptidase S58 DmpA  64.76 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4423  peptidase S58 DmpA  67.27 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.405309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3127  peptidase S58 DmpA  60.4 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4200  peptidase S58, DmpA  64.48 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3574  peptidase S58, DmpA  64.16 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115434  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4166  peptidase S58, DmpA  64.48 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3350  peptidase S58 DmpA  65.36 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.013595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1864  aminopeptidase DmpA  64.46 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  52.57 
 
 		 352 aa  318  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  51.67 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  52.27 
 
 		 351 aa  315  9e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  51.37 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3561  peptidase S58 DmpA  49.55 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.949161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0051  L-aminopeptidase/D-esterase  45.09 
 
 		 369 aa  299  4e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0531  D-aminopeptidase, putative  48.95 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0461  putative D-aminopeptidase  48.95 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  49.11 
 
 		 347 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  46.61 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0321  aminopeptidase DmpA  68.25 
 
 		 442 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1764  aminopeptidase DmpA  68.25 
 
 		 451 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0398  L-aminopeptidase/D-esterase  68.25 
 
 		 448 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.343359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0242  D-aminopeptidase  68.25 
 
 		 448 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1355  aminopeptidase DmpA  68.25 
 
 		 448 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1849  L-aminopeptidase/D-esterase  68.25 
 
 		 442 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1116  D-aminopeptidase, putative  67.13 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  41.88 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  48.82 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3571  peptidase S58 DmpA  44.31 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985399  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  43.58 
 
 		 375 aa  225  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  41.06 
 
 		 489 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  44.35 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  40.76 
 
 		 489 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  40.76 
 
 		 489 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3094  peptidase S58 DmpA  39.12 
 
 		 352 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0856606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  44.58 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  40.06 
 
 		 463 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5913  aminopeptidase  44.28 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  42.07 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  43.16 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  42.23 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17440  L-aminopeptidase DmpA  43.71 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3141  peptidase S58, DmpA  39.34 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.478527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1479  peptidase S58 DmpA  42.07 
 
 		 318 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3844  D-aminopeptidase putative  40.18 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  39.77 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2464  aminopeptidase  43.41 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00184488  normal  0.106032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3384  peptidase S58, DmpA  38.97 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  41.62 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  41.33 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6011  peptidase S58 DmpA  38.95 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5206  aminopeptidase DmpA  40.17 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5294  aminopeptidase DmpA  40.17 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5586  aminopeptidase DmpA  40.17 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.237816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0605  peptidase S58 DmpA  39.53 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  43.41 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2806  peptidase S58 DmpA  38.18 
 
 		 375 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  42.11 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  42.11 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  42.11 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4251  aminopeptidase DmpA  38.97 
 
 		 372 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3737  peptidase S58, DmpA  43.84 
 
 		 369 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0673701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4211  peptidase S58 DmpA  44.13 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  41.4 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  42.69 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  42.4 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  42.4 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1684  aminopeptidase DmpA  43.55 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  41.43 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4044  peptidase S58, DmpA  43.62 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4322  peptidase S58, DmpA  43.62 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.810072  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3199  peptidase S58 DmpA  43.32 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4288  peptidase S58 DmpA  42.31 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1047  aminopeptidase DmpA  37.96 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0633499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  33.82 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  31.34 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  30.04 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  28.8 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  32.73 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  32.62 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  32.61 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  31.99 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  31.88 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  36.08 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  35.2 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  29.14 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  31.71 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  28.66 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>