113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1488 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 335 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  70.66 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  60.65 
 
 		 356 aa  350  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  62.24 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  57.65 
 
 		 340 aa  342  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  59.52 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  56.69 
 
 		 328 aa  328  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  56.5 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  59.04 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  60.24 
 
 		 329 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  60.75 
 
 		 333 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  59.16 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  53.64 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  59.82 
 
 		 329 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  59.51 
 
 		 329 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  57.94 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  53.64 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  54.85 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  51.82 
 
 		 331 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  51.52 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  53.64 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  58.1 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  52.42 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  57.78 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  58.18 
 
 		 353 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  52.37 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  50.3 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  50.92 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  50.15 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  52.8 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  52.8 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  52.8 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  47.98 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  52.8 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  44.71 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  41.59 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  44.83 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  44.61 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  44.8 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  43.94 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  41.8 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  50 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  45.17 
 
 		 368 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  45.17 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  38.72 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  42.57 
 
 		 349 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  38.32 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  42.52 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  39.69 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  45.02 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  43.77 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  46.31 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  43.03 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  41.26 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  41.59 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  44.48 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  41.1 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  41.14 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  34.38 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  43.79 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  34.52 
 
 		 361 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  37.59 
 
 		 322 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  39.42 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  36.62 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  38.44 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  37.85 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  39.5 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  36.86 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  31.34 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  37.54 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  33 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  55.17 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  28.12 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  27.46 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4594  peptidase S58, DmpA  29.09 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  28.7 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  28.7 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  28.7 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  28.7 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  28.7 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  28.7 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  29.39 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3006  peptidase S58 DmpA  27.88 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2592  peptidase S58 DmpA  31.85 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2891  peptidase S58 DmpA  25.27 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2046  peptidase S58 DmpA  25 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173525  hitchhiker  0.00567247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  25.72 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0304  peptidase S58 DmpA  32.19 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  48.86 
 
 		 204 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  27.04 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  28.28 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  32.48 
 
 		 489 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  32.48 
 
 		 489 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  27.52 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  32.48 
 
 		 489 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4222  peptidase S58 DmpA  33.09 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  29.95 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1650  D-aminopeptidase, putative  26.85 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3106  peptidase S58, DmpA  30.95 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  33.1 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>