71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6005 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  100 
 
 		 330 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  38.03 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  35.99 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  34.49 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  32.8 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  32.8 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  32.8 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  30.38 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  30.79 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  30.35 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  37.92 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  30.57 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  34.15 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  34.74 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  35.47 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  28.81 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  34.71 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  34.59 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  36.53 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  33.53 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  34.02 
 
 		 329 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  35.26 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  33.55 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  34.11 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  34.41 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  34.65 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  34.73 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  32.26 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  32.14 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  33.01 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  30.94 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  33.12 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  29.83 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  31.21 
 
 		 347 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  30.1 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  27.35 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  33.33 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  32.11 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  30.62 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  30.94 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  33.56 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  33.7 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  32.44 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  33.33 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  33.33 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  33.33 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  31.97 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  32.07 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  28.62 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  34.6 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  32.79 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  31.21 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  33.44 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  32.29 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  30.74 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  32.43 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  31.17 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  32.47 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  27.61 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  31.96 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  24.49 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  29.35 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  30 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  30.66 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  37.5 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  31.4 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  28.04 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  35.44 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  30.82 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  36.78 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  38 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>