120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4346 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4346  peptidase S58 DmpA  100 
 
 		 299 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2945  peptidase S58, DmpA  59.16 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  62.31 
 
 		 322 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04100  L-aminopeptidase/D-esterase  54.18 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.037097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  52.74 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  52.74 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  52.74 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29210  L-aminopeptidase/D-esterase  51.94 
 
 		 345 aa  205  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  41.77 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2351  peptidase S58, DmpA  47.77 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  41.79 
 
 		 368 aa  188  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  42.77 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  41.79 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  45.9 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  44.41 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  41.03 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  45.68 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  47.62 
 
 		 344 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4294  peptidase S58, DmpA  47.2 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0972  peptidase S58 DmpA  48.48 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.898884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  43.67 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2093  peptidase S58 DmpA  46.06 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201096  normal  0.024132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  44.41 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0311  peptidase S58 DmpA  43.73 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1488  peptidase S58 DmpA  42.76 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0291995 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  38.52 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2906  peptidase S58 DmpA  46.48 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2156  peptidase S58 DmpA  50.52 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4618  peptidase S58 DmpA  46.78 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4768  peptidase S58 DmpA  45.62 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0772  peptidase S58, DmpA  44.37 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.904933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2319  peptidase S58 DmpA  41.89 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212071  decreased coverage  0.00000119169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4248  peptidase S58 DmpA  46.44 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1669  peptidase S58, DmpA  45.61 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1287  peptidase S58, DmpA  43.82 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0721739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1616  peptidase S58, DmpA  41.32 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5330  hypothetical protein  39.44 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12369  normal  0.395647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0620  peptidase S58, DmpA  45.96 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  39.09 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4338  peptidase S58 DmpA  39.5 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2667  peptidase S58, DmpA  41.95 
 
 		 340 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0463  peptidase S58, DmpA  42.86 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1773  peptidase S58, DmpA  38.99 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.800376  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  46.1 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  33.64 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  41.12 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  40.62 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  33.64 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2889  putative peptidase  45.68 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00143546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1203  peptidase S58 DmpA  42.16 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.794666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3687  peptidase S58, DmpA  38.68 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  37.54 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  38.69 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  38.68 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3882  hypothetical protein  42.33 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.482216  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  43.51 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2215  peptidase S58, DmpA  41.62 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2617  peptidase S58, DmpA  40.62 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2133  peptidase S58, DmpA  42.09 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.74532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  32.18 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4121  peptidase S58 DmpA  41.44 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246913  normal  0.677622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2264  peptidase S58 DmpA  42.72 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4493  peptidase S58 DmpA  40.32 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  37.5 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4203  peptidase S58 DmpA  41.14 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3087  peptidase S58 DmpA  40.74 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  38.38 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  38.94 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  41.8 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1804  peptidase S58, DmpA  55.75 
 
 		 350 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374201 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2376  peptidase S58 DmpA  29.89 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6005  peptidase S58, DmpA  33.55 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6180  peptidase S58 DmpA  31.44 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3656  aminopeptidase DmpA  29.14 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.950122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3840  hypothetical protein  32.65 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45210  hypothetical protein  32.41 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1007  peptidase S58, DmpA  56.67 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1411  peptidase S58 DmpA  29 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1507  peptidase S58 DmpA  29 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2448  aminopeptidase DmpA  29 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.357188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2417  peptidase S58 DmpA  32.8 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3974  peptidase S58 DmpA  30.35 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1419  peptidase S58 DmpA  28.7 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0592  putative D-aminopeptidase  31.96 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0875  putative D-aminopeptidase  31.96 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1842  putative D-aminopeptidase  31.96 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1200  peptidase S58 DmpA  30.91 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5170  peptidase S58 DmpA  28.62 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935854  normal  0.481324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5706  peptidase S58 DmpA  34.81 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0995  aminopeptidase DmpA  31.54 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4401  peptidase S58 DmpA  30.03 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4112  peptidase S58 DmpA  29.3 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3533  peptidase S58, DmpA  28.79 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1411  peptidase S58, DmpA  28.53 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.704657  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0143  peptidase S58 DmpA  30.6 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0984939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2559  peptidase S58 DmpA  30.48 
 
 		 367 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2326  peptidase  33.33 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1108  putative D-aminopeptidase  33.33 
 
 		 376 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1022  putative D-aminopeptidase  33.33 
 
 		 376 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1923  aminopeptidase DmpA  30.37 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>